Fő típusok: Ide tartoznak a biguanidok, alkoholok, fenolok, szerves aminok, piridinek, izotiazolinonok és mások.
Jellemzők: Gyors baktericid hatást mutatnak; azonban viszonylag gyenge termikus stabilitásuk és tartósságuk van, és bizonyos káros mellékhatásokkal járhatnak. Könnyen kötődnek a baktérium- és penészsejt membránok felületén lévő anionos helyekhez, vagy reakcióba lépnek szulfhidril-csoportokkal, ezáltal megzavarják a fehérjeszintézist és a sejtmembránrendszert, ami hatékonyan gátolja a baktériumok és penészgombák szaporodását. Ennek ellenére hajlamosak a bomlásra ultraibolya fény hatására, ami rövid élettartamot eredményez; továbbá egyes szerves antimikrobiális szerek toxikus mellékhatásokat okozhatnak.
Alkalmazások: Jelenleg a legszélesebb körben kutatott és használt szerves felületaktív- antimikrobiális szerek a nitrogén-tartalmú kationos vegyületek,-mint például a kvaterner ammóniumsók-, amelyeket széles körben alkalmaznak antimikrobiális bevonatokban.
